アドバンスシミュレーション Vol.16, 谷森 奏一郎, 松原 聖, 粗視化分子動力学シミュレータAdvance/COGNACは、ソフトマテリアル解析シミュレータ Advance /OCTAのひとつのモジュールです。Advance/OCTAが扱う対象は、従来のソフトウェアでは簡単に扱えなかったソフトマテリアル、即ち、繊維・ゴムなどに関係する高分子、吸水性樹脂・塗料等に関係するコロイドやゲル、洗剤・石鹸等に関係する界面活性剤、ディスプレイ等に関連する液晶等です。Advance/OCTAによって、これらソフトマテリアルに対するシミュレーション解析を行うことができます。ここでは、Advance/OCTAのうち、Advance/COGNACについて述べます。Advance/COGNACは、汎用粗視化分子動力学プログラムであり、この計算エンジンはさまざまな外場（流れや変形）のもとでの高分子の動力学計算を行うことができます。フル・アトミスティックモデルでの分子動力学計算、ビーズ・スプリングモデルのように粗視化したモデルでの粗視化動力学計算が可能です。ここではAdvance /COGNACの機能と、そのマルチスレッドによる並列化について紹介します。(PDF：1,394kB)
初期構造(上) と100,000ステップ後の構造(下)。
