2005年3月号

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┃★月刊Ａｄｖａｎｃｅ　Ｎｅｗｓ　 2005年3月号
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　■目次
　▽今月のトピックス
　　　▲タンパク質量子化学計算ソフトウェア「Advance/ProteinDF」
　▽イベントのご案内
　　　▲次世代量子化学計算ソフトウェアAdvance/ProteinDF&BioStationセミナー
　▽書籍のご案内
　　　▲タンパク質量子化学計算　― Protein DFの夢と実現 ―

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│1. 今月のＴＯＰＩＣＳ
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　アドバンスソフト株式会社は、文部科学省ITプログラム「戦略的基盤ソフト
ウェアの開発」プロジェクトに携わっている民間企業です。バイオ・ナノ
シミュレーション、熱・流体解析、構造解析、統合プラットフォーム等の
次世代シミュレーションソフトウェアの開発を東京大学生産技術研究所計算
科学技術連携研究センターと共同で行なっています。
このコーナーでは、毎回、弊社が改良しパッケージソフトとしてご提供させ
ていただいているソフトウェアから１つを取り上げさせていただき、ご紹介
して参ります。

　さて、今月のTOPICSは、タンパク質量子化学計算ソフトウェア「Advance/ProteinDF」です。
「Advance/ProteinDF」は、非常に高い精度で、タンパク質の全電子計算を
実行することができます。

なぜ精度の高い計算が必要なのでしょうか？

　例えば鉄イオンを例にします。真空中における鉄のイオン化ポテンシャルは
約1000kcal/molです。鉄イオンがポルフィリンという化学物質と結合した、
いわゆるヘム鉄と呼ばれるものになりますと、イオン化ポテンシャルは
約100kcal/molとなります。このヘム鉄がタンパク質の中に取り込まれると、
イオン化ポテンシャルは数kcal/molとなります。ヘム鉄は、生体に非常に
関連のある物質です。例えば、赤血球中にはヘモグロビンという酸素の運搬
に関わるタンパク質がありますが、酸素の運搬に関わるのは、ヘモグロビン
の中のヘム鉄です。

　生体の中で、多様な機能性を発揮するタンパク質ですが、生体内における
タンパク質の機能研究を正確に行うためには、上の例でも示しましたように、
数kcal/mol以内のエネルギー精度が必要となります。すなわち、タンパク質
の機能研究を行うためには、精度の高い計算が必須なわけです。

　この精度の計算を実行することができるのが「Advance/ProteinDF」です。
「Advance/ProteinDF」は、密度汎関数法を採用した分子軌道法プログラムで、
タンパク質を細分化することなく、量子力学に基づいた計算を行います。
そのため、非常に精度の高い計算結果が得られます。

　「Advance/ProteinDF」により多くのタンパク質の機能の詳細が解明され、
生命現象の基礎過程に光があてられるとともに、人工タンパク質の設計を
定量的に行えることが期待されます。

また、「Advance/ProteinDF」の計算対象はタンパク質に限りません。
プログラムをカスタマイズすることにより、高分子やナノ物質など物質材料
全般への応用が期待されます。遺伝子工学、理論化学、生化学、ナノテクノ
ロジーなど幅広い分野で、革新的な研究開発に貢献できるポテンシャルを持つ
ソフトウェアです。

詳しくはホームページで。
http://www.advancesoft.jp/service/package/protein_df/index.html

　*Advance/ProteinDFは弊社が「戦略的基盤ソフトウェアの開発」 *
　*プロジェクトの成果物であるProteinDFの整備・機能追加を行い、*
*商用化したソフトウェアです。*

▲次回は、ナノ材料第一原理計算「Advance/PHASE」をご紹介します。

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│2. イベントご案内
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～　次世代量子化学計算ソフトウェア　～
　　　Advance/ProteinDF&BioStation　セミナーのご案内

　弊社では、文部科学省ITプログラム「戦略的基盤ソフトウェアの開発」
プロジェクトで開発された世界最先端ソフトAdvance/ProteinDFおよび
Advance/BioStationの販売を開始いたしました。
これらソフトの導入をご検討中の皆様を対象に、その具体的な内容等につい
て、セミナーを開催いたします。電子メールにてお申し込みを受け付けてお
りますので、参加をご希望の方は、「お申込みフォーム」に必要事項をご記入
の上office@advancesoft.jpまでお送りください。

日時：2005年3月11日（金）13:00～17:00

場所：私学振興会館・財団分室
　 住所：東京都千代田区富士見1－10－12
　 電話：03-3230-1326
　 交通：飯田橋駅（JR、地下鉄）から徒歩6分
　　九段下駅（地下鉄）から徒歩4分
プログラム：
　１）＜Advance/ProteinDF&BioStation＞の詳細機能と事例説明
　２）実演によるデモンストレーション
　３）価格、サポート体制、他
　４）質疑応答

参加費用：無料

▼お申込みフォーム：下記にご記入頂き、電子メールにてお送り下さい。▼
　｜第１回 Advance/ProteinDF&BioStation　セミナー参加申込みフォーム
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　　第１回 Advance/ProteinDF&BioStation　セミナー
　 　　　（日時：2005年3月11日（金））に参加を申し込みます。

貴社（校）名：
ご所属：
役職：
ふりがな：
ご氏名：
〒：
住所：
TEL：
FAX：
E-mail：
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‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥▼セミナー開催予定▼‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥
日程　　　　　　　　　名称
2005/3/29（火）第1回 構造解析用有限要素解析パッケージ Advance/pSANセミナー
2005/4月中旬 第2回 ナノ材料第一原理計算パッケージ Advance/PHASEセミナー
2005/5月中旬 第2回 次世代流体解析ソフトウェア Advance/FrontFlowセミナー
2005/6月上旬 第2回 次世代量子化学計算ソフトウェア Advance/ProteinDF*BioStationセミナー
2005/6月下旬 第2回 構造解析用有限要素解析パッケージ Advance/pSANセミナー
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　▼セミナー開催予定は、弊社ホームページでもご案内しています。
　　http://www.advancesoft.jp/

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│3. 書籍のご案内
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　文部科学省ITプログラム「戦略的基盤ソフトウェアの開発」プロジェクトの
ソフトウェア活用に役立つ書籍をご案内します。

タイトル：タンパク質量子化学計算　― Protein DFの夢と実現 ―
　　　　　（ISBN 4-9902143-0-7）

概要：「本書は、タンパク質の量子化学計算を実現するために開発された
ソフトウェア「ProteinDF」について解説したものである。「ProteinDF」は
世界ではじめて百残基規模の金属タンパク質の全電子計算に成功した。
そして現在においても、百残基規模の本格的なタンパク質の全電子計算が
可能なソフトウェアは「ProteinDF」しかない。
この「ProteinDF」によるタンパク質の全電子計算の成功により、タンパク質
の研究は新しいフェーズに突入したと言える‥‥」

詳細はこちら↓
　http://www.advancesoft.jp/service/public/book1.html
ご購入に関してはこちら↓
　http://www.advancesoft.jp/service/public/index.cgi

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│4. アドバンスソフト株式会社についてhttp://www.advancesoft.jp/
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　アドバンスソフト株式会社は、文部科学省のＩＴプログラム「戦略的基盤
ソフトウェア開発プロジェクト」を推進する民間企業として設立されました。
バイオ・ナノシミュレーション、熱・流体解析、構造解析、統合プラット
フォーム等、次世代シミュレーションソフトウエアの開発を東京大学生産
技術研究所計算科学技術連携研究センターと共に行なっております。
詳しい情報につきましては、ホームページをご覧ください。
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発行：アドバンスソフト株式会社　　　http://www.advancesoft.jp/
〒160-0017　東京都新宿区左門町16-2　日本生命四谷ビル4F
tel. 03-5366-1870 fax.03-5366-1871
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